PPspliT, menzionato sopra, sembra essere solo per Windows.
Se sei su OS X, un'opzione (non sempre perfetta) che ho usato è aprire il file PPT/PPTX in Keynote. Dalla barra dei menu, seleziona “File > Esporta in > PDF…” . Poi spunta la casella di controllo “Stampa ogni fase della costruzione”, e clicca su “Avanti…”. Attenzione: non essendo il suo formato nativo, Keynote non sempre legge i file PowerPoint in modo corretto. Controlla che qualsiasi diapositiva complessa (non solo animazioni, ma anche quelle che contengono cose come formule matematiche che richiedono una formattazione precisa) sia stata riprodotta fedelmente. In caso contrario, regola di conseguenza in Keynote per correggere qualsiasi aberrazione.
Non ho testato personalmente quanto segue, ma per una soluzione cross-OS: Per LibreOffice (che ha anche l'importazione di PPT/PPTX), c'è questa estensione e questa . Nota, però, che quest'ultima rasterizza tutto in bitmap, il che può essere molto indesiderabile, a seconda del tuo scopo.